Die erste King’s Chapel wurde 1686 aus Holz erbaut und war die erste Church of  England€ in der Stadt Boston. Diese hölzerne Kirche wurde später durch die heutige Kirche, die aus Stein gebaut wurde ersetzt.

Der Grundstein für die heutige King’s  Chappel wurde am 11. August 1749 gelegt. Heute führt auch der Freedom Trail direkt an der Kirche vorbei. Nach dem amerikanischen  Unabhängigkeitskrieg wurde es die erste unitaristische Kirche der USA. Neben der  King’s Chappel befindet sich der King’s Chappel Burying Ground. Auf diesem historischen Friedhof wurden diverse bekannte Persönlichkeiten beerdigt, wie beispielsweise der erste Gouverneur der Massachusetts Bay Colony: John Winthrop. Auch Elizabeth Paine, die  als Vorlage für den Roman ”Der scharlachrote Buchstabe”€� (The Scarlett  Letter) verwendet wurde liegt auf dem King’s Chappel Burying Ground  beerdigt. In der Verfilmung wird Elizabeth Paine von Demi Moore gespielt.